Program kesehatan dan kebersihan lingkungan adalah program penting untuk memastikan siswa memahami pentingnya menjaga kebersihan dan kesehatan. Program ini meliputi kegiatan seperti pemeriksaan kesehatan rutin, penyuluhan gizi, serta kampanye hidup bersih dan sehat. Sekolah juga biasanya menyediakan fasilitas cuci tangan, serta mengadakan jadwal piket kebersihan di kelas dan lingkungan sekolah.
Selain itu, banyak sekolah yang mengadakan program “Adiwiyata” atau “Sekolah Hijau,” di mana siswa diajarkan tentang pentingnya menjaga lingkungan. Kegiatan seperti menanam pohon, memilah sampah, dan daur ulang juga diajarkan untuk menumbuhkan kesadaran lingkungan pada anak-anak. Program ini bertujuan agar siswa memiliki kebiasaan hidup sehat serta peduli terhadap lingkungan sekitar.